二手基因測序儀 是測序產(chǎn)業(yè)鏈的起點(diǎn)也是關(guān)鍵環(huán)節,它為整個(gè)中下游測序服務(wù)提供基本的測序支撐,同時(shí)也處于基因測序產(chǎn)業(yè)價(jià)值鏈頂端?;驕y序儀對于基因產(chǎn)業(yè)的重要性,如同發(fā)動(dòng)機之于汽車(chē)行業(yè),芯片之于電子通信行業(yè)。
基因測序也稱(chēng)DNA測序,是現代生物學(xué)研究中重要的手段之一?;驕y序技術(shù)經(jīng)過(guò)了三個(gè)發(fā)展階段。
一代測序:指雙脫氧末端終止法,擴增后通過(guò)毛細管電泳讀取序列,每次獲取數據量少。
二代測序:為高通量測序,采用微珠或高密度芯片邊合成邊測序,代表有454,Solexa,SOLID,高通量,可一次獲得數G數據,相對與第三代,都仍然需要擴增的方法放大信號,擴增后再檢測。
三代測序:特點(diǎn)是單分子測序,多基于納米科技,無(wú)需擴增,對單分鏈DNA/RNA直接用合成、降解、通過(guò)納米孔等方源式直接測序,核心特點(diǎn)是無(wú)需擴增所以成本更低。
Roche公司的454測序平臺、Illumina公司的Solexa測序系統以及ABI公司的SOLID測序系統標志著(zhù)二代測序技術(shù)誕生。盡管各系統在高通量水平、測序準確度、存儲格式、技術(shù)方法上各有差異,但共同特征是大大降低了測序成本并大大地提高了測序速度,完成一個(gè)人的基因組測序只需一周左右時(shí)間。然而二代測序技術(shù)在測序前要通過(guò)PCR段對待測片段進(jìn)行擴增,增加了測序的錯誤率。而且二代測序產(chǎn)生的測序結果長(cháng)度較短,需要對測序結果進(jìn)行人工拼接,因此比較適合于對已知序列的基因組進(jìn)行重新測序,而在對全新的基因組進(jìn)行測序時(shí)還需要結合一代測序技術(shù)。
簡(jiǎn)而言之: Roche 454是焦磷酸測序; illumina Solexa是合成法測序; ABI SOLID是連接法測序。
就讀長(cháng)來(lái)看: Roche 454 > illumina Solexa > ABI SOLID。
就Reads數來(lái)看: ABI SOLID > illumina Solexa > Roche 454。
就應用來(lái)看: Roche 454讀長(cháng)較長(cháng),便于拼接 ,因此在denovo測序方面有很大優(yōu)勢;ABI SOLID雖然讀長(cháng)很短,但是Reads數多,而且ABI的色球編碼技術(shù),使得每個(gè)堿基都會(huì )被讀取兩遍,準確率很腐, 因此ABI SOL心在檢測SNP、轉錄組測序、ChIP-Seq等方面很有優(yōu)勢;illumina Solexa的讀長(cháng)和Reads數均位于中間,比較適合于基因組重測序。而在實(shí)際應用中 ,由千Roche 454成本太商,因此illumina Solexa 也被較多的應用于denovo測序。
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